CRAN Package Check Results for Package spinebil

Last updated on 2025-09-27 01:50:38 CEST.

Flavor Version Tinstall Tcheck Ttotal Status Flags
r-devel-linux-x86_64-debian-clang 1.0.4 3.42 150.18 153.60 OK
r-devel-linux-x86_64-debian-gcc 1.0.4 2.52 93.64 96.16 ERROR
r-devel-linux-x86_64-fedora-clang 1.0.4 260.63 OK
r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc 1.0.4 234.11 OK
r-devel-windows-x86_64 1.0.4 8.00 197.00 205.00 OK
r-patched-linux-x86_64 1.0.4 3.93 137.11 141.04 OK
r-release-linux-x86_64 1.0.4 3.54 127.85 131.39 OK
r-release-macos-arm64 1.0.4 77.00 OK
r-release-macos-x86_64 1.0.4 87.00 OK
r-release-windows-x86_64 1.0.4 5.00 204.00 209.00 OK
r-oldrel-macos-arm64 1.0.4 68.00 OK
r-oldrel-macos-x86_64 1.0.4 109.00 OK
r-oldrel-windows-x86_64 1.0.4 8.00 246.00 254.00 OK

Check Details

Version: 1.0.4
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: ... --- re-building ‘more_descriptives.qmd’ using html <1b>[31m processing file: more_descriptives.qmd <1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ─────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��───────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ───────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��─────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ─────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31m <1b>[39m<1b>[31mProgress: ───────────────────────────────────────�<1b>[39m<1b>[31m��──────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31m Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%<1b>[39m<1b>[31moutput file: more_descriptives.knit.md <1b>[39m<1b>[1mpandoc <1b>[22m to: html output-file: more_descriptives.html standalone: true embed-resources: true wrap: none default-image-extension: png css: - >- /home/hornik/tmp/R.check/r-devel-gcc/Work/build/Packages/quarto/rmarkdown/template/quarto_vignette/resources/vignette.css variables: {} <1b>[1mmetadata<1b>[22m document-css: false lang: en minimal: true theme: none title: Exploring Potential of Functions to be used for Projection Pursuit vignette: | %\VignetteIndexEntry{More Descriptive Analysis of Projection Pursuit Indices} %\VignetteEngine{quarto::html} %\VignetteEncoding{UTF-8} Output created: more_descriptives.html --- finished re-building ‘more_descriptives.qmd’ --- re-building ‘ppi_diagnostics.qmd’ using html <1b>[31m processing file: ppi_diagnostics.qmd <1b>[39m<1b>[31mError in `dplyr::summarise()`: ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`. ℹ In group 1: `Var1 = V2` `Var2 = V1`. Caused by er<1b>[39m<1b>[31mror in `colnames<-`: ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions Backtrace: ▆ 1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50) 2. │ └─spinebil (local) idx(dprj) 3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name) 4. │ └─... %>% dplyr::ungroup() 5. ├─dplyr::ungroup(.) 6. ├─dplyr::summarise(...) 7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...) 8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise") 9. │ ├─base::withCallingHandlers(...) 10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask) 11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...) 12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...) 13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo) 14. │ └─dplyr (local) eval() 15. ├─cassowaryr:::intermediate_scags(...) 16. │ └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid) 17. │ └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y) 18. │ └─cassowaryr::scree(new_x, new_y) 19. │ └─alphahull::delvor(xy) 20. │ └─interp::tri.mesh(X) 21. │ └─base::`colnames<-`(...) 22. │ └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions") 23. └─base::.handleSimpleError(...) 24. └─dplyr (local) h(simpleError(msg, call)) 25. └─dplyr (local) handler(cnd) 26. └─rlang::abort(message, class = error_class, parent = parent, call = error_call) Quitting from ppi_diagnostics.qmd:279-287 [unnamed-chunk-7] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ <1b>[39m<1b>[31mExecution halted <1b>[39m<1b>[33mWARN: Should not have arrived here:<1b>[39m <1b>[91mERROR: [non-error-thrown] undefined Stack trace: at _Command.handleError (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:10032:117) at _Command.parseCommand (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:9719:12) at eventLoopTick (ext:core/01_core.js:178:7) at async quarto (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175522:5) at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175550:5 at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175405:14 at async mainRunner (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175407:5) at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175543:3<1b>[39m Error: processing vignette 'ppi_diagnostics.qmd' failed with diagnostics: ! Error running quarto CLI from R. Caused by error in `quarto_render()`: ✖ Error returned by quarto CLI. ----------------------------- processing file: ppi_diagnostics.qmd <1b>[31mError in `dplyr::summarise()`:<1b>[39m ℹ In argument: `intermediate_scags(...)`. ℹ In group 1: `Var1 = V2` `Var2 = V1`. Caused by er<1b>[31mror in `colnames<-`:<1b>[39m ! attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions Backtrace: ▆ 1. ├─spinebil::profile_rotation(d, index_list, index_labels, n = 50) 2. │ └─spinebil (local) idx(dprj) 3. │ └─cassowaryr::calc_scags_wide(as.data.frame(mat), index_name) 4. │ └─... %>% dplyr::ungroup() 5. ├─dplyr::ungroup(.) 6. ├─dplyr::summarise(...) 7. ├─dplyr:::summarise.grouped_df(...) 8. │ └─dplyr:::summarise_cols(.data, dplyr_quosures(...), by, "summarise") 9. │ ├─base::withCallingHandlers(...) 10. │ └─dplyr:::map(quosures, summarise_eval_one, mask = mask) 11. │ └─base::lapply(.x, .f, ...) 12. │ └─dplyr (local) FUN(X[[i]], ...) 13. │ └─mask$eval_all_summarise(quo) 14. │ └─dplyr (local) eval() 15. ├─cassowaryr:::intermediate_scags(...) 16. │ └─cassowaryr::calc_scags(x, y, scags, out.rm, euclid) 17. │ └─cassowaryr:::original_and_robust(x, y) 18. │ └─cassowaryr::scree(new_x, new_y) 19. │ └─alphahull::delvor(xy) 20. │ └─interp::tri.mesh(X) 21. │ └─base::`colnames<-`(...) 22. │ └─base::stop("attempt to set 'colnames' on an object with less than two dimensions") 23. └─base::.handleSimpleError(...) 24. └─dplyr (local) h(simpleError(msg, call)) 25. └─dplyr (local) handler(cnd) 26. └─rlang::abort(message, class = error_class, parent = parent, call = error_call) Quitting from ppi_diagnostics.qmd:279-287 [unnamed-chunk-7] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ <1b>[31mExecution halted<1b>[39m <1b>[33mWARN: Should not have arrived here:<1b>[39m <1b>[91mERROR: [non-error-thrown] undefined<1b>[39m Stack trace: at _Command.handleError (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:10032:117) at _Command.parseCommand (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:9719:12) at eventLoopTick (ext:core/01_core.js:178:7) at async quarto (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175522:5) at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175550:5 at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175405:14 at async mainRunner (file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175407:5) at async file:///opt/quarto/bin/quarto.js:175543:3 Caused by error: ! System command 'quarto' failed --- failed re-building ‘ppi_diagnostics.qmd’ --- re-building ‘spinebil.qmd’ using html <1b>[31m processing file: spinebil.qmd <1b>[39m<1b>[31moutput file: spinebil.knit.md <1b>[39m<1b>[1mpandoc <1b>[22m to: html output-file: spinebil.html standalone: true embed-resources: true wrap: none default-image-extension: png css: - >- /home/hornik/tmp/R.check/r-devel-gcc/Work/build/Packages/quarto/rmarkdown/template/quarto_vignette/resources/vignette.css variables: {} <1b>[1mmetadata<1b>[22m document-css: false lang: en minimal: true theme: none title: An introduction to the spinebil package vignette: | %\VignetteIndexEntry{An introduction to the spinebil package} %\VignetteEngine{quarto::html} %\VignetteEncoding{UTF-8} Output created: spinebil.html --- finished re-building ‘spinebil.qmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘ppi_diagnostics.qmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-devel-linux-x86_64-debian-gcc